Microbiologie

Les domaines clés

Virus, bactéries, parasites - il y a beaucoup d'organismes vivants qui ne sont pas visibles à l'œil nu, mais qui ont néanmoins une grande importance pour la santé humaine et animale. Ils sont soit à l'origine de maladies, soit bénéfiques pour la santé, comme le microbiome de l'intestin.

C'est précisément la raison pour laquelle la microbiologie est si importante - pour la médecine, les biosciences, les produits pharmaceutiques et l'industrie alimentaire.

La microbiologie peut être divisée en deux domaines principaux : la microbiologie fondamentale et la microbiologie appliquée. La microbiologie fondamentale se concentre sur l'étude des différents micro-organismes. La microbiologie appliquée vise principalement à étudier les interactions des micro-organismes avec l'environnement ou d'autres organismes vivants. Dans les deux domaines, un accès aux différents micro-organismes est essentiel.

Pour ces deux domaines clés, nous mettons à votre disposition des outils de haute qualité - pour toutes les tâches, du prélèvement d'échantillons à l'analyse en passant par la culture. Nos solutions reposent sur notre vaste expérience dans le domaine de la médecine et de la recherche et répondent aux exigences les plus élevées en termes de qualité, de pureté et de confort. Découvrez notre vaste gamme de produits et profitez de notre expertise dans le domaine de la microbiologie.

Trois étapes fondamentales pour la recherche, la médecine et l'industrie

Quel que soit le domaine d'application de la microbiologie, travailler avec des micro-organismes implique généralement trois étapes essentielles : le prélèvement, la culture et l'analyse.

Prélèvement d'échantillons

Avant de procéder à l'échantillonnage, il est essentiel de répondre aux questions suivantes : À quoi servent les micro-organismes ? Quel est l'objet de l'analyse ou de la recherche ? Par exemple, l'objectif est-il de trouver la thérapie idéale pour une infection chez l'homme ou l'animal ? Doit-on prouver l'absence de certains micro-organismes - notamment dans l'industrie alimentaire ? S'agit-il de rechercher spécifiquement certains organismes parce qu'ils pourraient être décisifs pour le prochain médicament, le "blockbuster", dans l'industrie pharmaceutique ?

Prélèvement d'échantillons : Le choix de l'outil

Le choix de la méthode de prélèvement d'échantillons dépend directement du lieu de prélèvement.

L'écouvillon

Lorsqu'il s'agit de prélever des échantillons de surfaces ou de cavités corporelles humaines ou animales, les écouvillons sont l'outil idéal. Ils sont particulièrement adaptés pour le transport d'échantillons bactériologiques et cytologiques qui en découle.

Les écouvillons se déclinent en différentes versions et matériaux en fonction de leur utilisation. Ils existent avec une tige en plastique solide ou en aluminium flexible. Les variantes avec ou sans milieu de transport sont adaptées pour le transport sur de longs trajets ou pour les micro-organismes particulièrement sensibles permettant ainsi leur stabilisation. L'ajout de charbon dans le milieu de transport de certaines variantes permet la neutralisation des toxines bactériennes et d'autres substances inhibitrices.

Pour les échantillons d'urine et de selles

L'hygiène est particulièrement importante lors du prélèvement d'échantillons d'urine et de selles. Pour les échantillons liquides tels que l'urine, le principe d'aspiration sans aiguille est recommandé, permettant de prélever la quantité nécessaire à partir du pot de recueil. L’aspiration est la méthode la plus douce pour transférer l'urine dans des récipients secondaires. Ceci est scientifiquement prouvé (voir l'article de Delanghe et al.). Un autre principe est le système sous vide, dans lequel l'urine est transférée dans un tube sous vide.

Pour les échantillons de selles, les tubes à selles sont recommandés, disponibles dans différentes tailles. Dans ce cas, l'échantillon est simplement et proprement recueilli dans le tube à l'aide d'une cuillère intégrée dans le couvercle.

Culture de micro-organismes

Une fois les échantillons prélevés, les micro-organismes sont mis en culture. Différentes techniques et matériaux sont utilisés en fonction de l'analyse à réaliser.

La boîte de Petri

Les boîtes de Petri sont l’outil classique pour la culture des micro-organismes. Disponibles dans différentes tailles, elles sont idéales pour travailler avec des milieux nutritifs chauds pour la culture du fait de leurs résistance à la chaleur jusqu'à 80 °C. De plus, elles sont également disponibles dans différentes versions. Les boîtes de Petri sont proposées avec ou sans ergots de ventilation. Le choix entre ces 2 versions dépend du type de culture. Avec des ergots, les boîtes de Petri offrent un meilleur échange gazeux alors que sans, le taux d'évaporation réduit permet des temps d'incubation plus longs. De plus, il existe des boîtes de Petri subdivisées en différentes zones, ce qui permet des études parallèles dans des conditions comparables ou l'utilisation de différents types de gel. Un autre avantage est que les boîtes de Petri sont facilement empilables et peuvent être transportées de manière optimale et cultivées en grandes quantités dans le laboratoire à l'aide de supports de boîtes.

Analyse des micro-organismes cultivés

L'objectif de l'analyse est d'une part de démontrer la présence d'un micro-organisme spécifique sur le site de prélèvement des échantillons. D'autre part, il s'agit souvent de quantifier ces micro-organismes, c'est-à-dire de déterminer leur quantité sur le site de prélèvement. Souvent, la présence de micro-organismes est considérée comme non critique jusqu'à une limite définie, et elle n'est considérée comme critique ou dangereuse pour la santé que si cette limite est dépassée.

Selon la question posée, différentes méthodes sont utilisées, telles que des analyses photométriques ou microscopiques. Des techniques telles que les immuno-essais - comme les tests ELISA (tests immuno-enzymatiques) - et les réactions en chaîne par polymérase (PCR) sont également utilisées.

Élimination des matériaux contaminés

Après la culture et l'analyse des échantillons, ceux-ci ne sont généralement plus nécessaires et sont jetés - mais bien sûr, pas n'importe comment.

Les substances biologiques sont classées en quatre niveaux de protection différents selon la directive de l' UE, le niveau de protection 1 représentant le plus faible risque et le niveau de protection 4 le risque le plus élevé. Les déchets sont collectés dans des sacs de destruction ou d'autoclavage, disponibles en différentes tailles. Ces sacs doivent être étiquetés selon le niveau de protection correspondant, par exemple avec le symbole de danger biologique "Biohazard". Avant d'être éliminé correctement, le matériel doit être autoclavé. Les sacs doivent pouvoir supporter des température élevées allant jusqu’à 134 °C pour passer en autoclave.

Conservation des échantillons

A l’issue de l'analyse, il est souvent nécessaire de conserver des échantillons ou de les stocker pour une analyse ultérieure. Un exemple connu est la collection de micro-organismes de l'Institut Leibniz DSZM Deutsche Sammlung von Mikroorganismen und Zellkulturen, où les chercheurs ont découvert, grâce à de nouvelles technologies, de nouvelles propriétés productrices d'antibiotiques chez une bactérie déjà utilisée en recherche depuis 40 ans.La conservation des échantillons peut parfois avoir des raisons légales comme dans l'industrie alimentaire où un échantillon de référence doit être conservé pour les produits contenant des ingrédients à base d'œufs de poule crus.

Les bons contenants pour la conservation

Surtout pour la conservation des échantillons, les contenants doivent répondre à des exigences particulières, comme être résistants au froid pour la congélation des échantillons. Il doivent aussi être durables afin que des succès de recherche puissent être célébrés même après 40 ans et plus ! Des tubes à réaction, des microtubes à vis, des plaques Deep Well et des cryotubes sont utilisés pour répondre à différentes exigences de stockage.

Soins et pureté

Le soin et la propreté sont primordiaux pour tous les travaux microbiologiques afin d'obtenir des résultats significatifs, justes et fiables.À cette fin, des produits stériles sont essentiels.

Pour certaines analyses - comme lors du travail avec des acides nucléiques dans le cadre des techniques de PCR - des exigences supplémentaires sont imposées aux matériaux.